一，内分泌因素

    该因素是常见的卵巢囊肿的病因，卵巢虽小，却是产生卵子并排卵、内分泌激素、平衡内分泌的重要器官，多发生于内分泌旺盛的生育年龄。所以认为与内分泌失调有关。

    二、分娩、多次流产等：
    巧克力囊肿主要是由于月经期子宫壁脱落的子宫内膜碎片因引流不畅，不能全部从阴道排出，有少量经输卵管向盆腔倒流。凡是能影响月经血从阴道流出的，包括阴道闭锁、子宫颈口狭小、子宫后倾、多次人工流产后子宫颈口粘连、月经期性生活等，都能引发巧克力囊肿。

    三、输卵管阻塞：
    每月卵巢内没有受精的卵泡成为废品垃圾也要排泄出去，必须靠体内液压把这些垃圾挤出来，由于机能减退，加上输卵管有堵塞现象，垃圾排不出来，排不出去的卵子堆积在卵巢内，就形成了巧克力囊肿。

    四、性生活频繁：
    性生活频繁也是导致卵巢巧克力囊肿的重要原因，一般发病多在青春期少女或更期妇女，这与她们频繁性生活有很大关系。

    五、生理原因：
    女性的子宫内膜在正常的情况下面是在宫腔之中生长的，随着每个月女性生理期的到来，其会剥落之后重新开始增厚生长。但是由于内膜开始在女性的卵巢进行生长，但是在生理期的时候这一部分的内膜并不会随着离开自己的，而是在卵巢的位置淤积，随着长在卵巢位置的内膜不断增厚，淤积的内膜会越来越多，使得卵巢的位置出现了囊肿。